Журнал ИМТ
Статья журнала ИМТПубликацияНаучная статья
ИНФОРМАЦИОННАЯ ИНФР АСТРУКТУР А ДЛЯ ПОДДЕРЖКИ ИССЛЕДОВАНИЙ МИКРОБИОМА БАЙКАЛА
http://libmeta.ru/object/imt_pub_32
Аннотация
Рассмотрена проблема построения исследовательской среды для обработки данных секвенирования нового поколения ( NGS – Next Generation Sequencing). Среда включает облачное хранилище данных (DaaS) и вычислительные службы (SaaS и PaaS), а также службы визуализ ации и интеграции данных. Осуществляется интеграция технологий с открытым исходным кодом для поддержки MiSeq SOP (стандартная операционная процедура), которая позволяет специалистам в предметной области – биологам независимо от программистов самостоятельн о обрабатывать данные. Для реализации интеграции конструируются формальные модели SOP, позволяющие автоматически порождать исходный код компонентов среды. Технология преобразования основана на принципах архитектуры, управляемой моделями (Model driven archi tecture), и логическом выводе структур производных моделей и модулей. Представлены текущие результаты и задачи на ближайшую перспективу.
Данные
| pages | 108-121 |
| год | 2020 |
| pageEnd | 121 |
| pageStart | 108 |
тема
цитирует
Next-generation sequencing data analysis on cloud computing
A next-generation sequencing data analysis pipeline for detecting unknown patho…
An instrumental environment for metagenomic analysis
Programming patterns for Logtalk parametric objects
Representation of MDA transformation with logical objects
Sub-ice microalgal and bacterial communitie in freshwater lake Baikal
The SILVA ribosomal RNA gene database project: improved data processing and web…
A comparison of three programming languages for a full-fledged next generation …
Visual programming for next-generation sequencing data analytics
Yo JHipster: a playground for web-apps analyses
Вычислительные проблемы анализа ошибок коротких прочтений ДНК при секвенировани…
Bioinformatics and computational tools for next-generation sequencing analysis …
+14
ссылается на
Next-generation sequencing data analysis on cloud computing
A next-generation sequencing data analysis pipeline for detecting unknown patho…
An instrumental environment for metagenomic analysis
Programming patterns for Logtalk parametric objects
Representation of MDA transformation with logical objects
Sub-ice microalgal and bacterial communitie in freshwater lake Baikal
The SILVA ribosomal RNA gene database project: improved data processing and web…
A comparison of three programming languages for a full-fledged next generation …
Visual programming for next-generation sequencing data analytics
Yo JHipster: a playground for web-apps analyses
Вычислительные проблемы анализа ошибок коротких прочтений ДНК при секвенировани…
Bioinformatics and computational tools for next-generation sequencing analysis …
+14
ключевое слово
опубликовано в
в аннотации
упоминает понятие
Входящие связи
← содержит статью · 1
Внешние ссылки
- https://www.imt-journal.ru/archive/public/article?id=170 (fullTextUrl)